Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpaQ62189 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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