Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pacsin1Q61644 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms