Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim25Q61510 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms