Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnhQ61458 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CcnhQ61458 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CcnhQ61458 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms