Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Klf3Q60980 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Klf3Q60980 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms