Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sik1Q60670 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms