Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3aQ60520 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms