Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tnfsf15Q5UBV8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms