Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Utp18Q5SSI6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Utp18Q5SSI6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms