Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms