Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Lrrc47Q505F5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc47Q505F5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Lrrc47Q505F5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Lrrc47Q505F5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Lrrc47Q505F5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrc47Q505F5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrc47Q505F5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Lrrc47Q505F5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc47Q505F5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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