Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Esf1Q3V1V3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Esf1Q3V1V3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms