Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc110Q3V125 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms