Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC051142Q3V0M8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms