Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim80Q3V061 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim80Q3V061 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trim80Q3V061 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim80Q3V061 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim80Q3V061 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim80Q3V061 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim80Q3V061 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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