Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnpc3Q3UZ01 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rnpc3Q3UZ01 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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