Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm28047Q3US59 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms