Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms