Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cobll1Q3UMF0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms