Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cog7Q3UM29 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cog7Q3UM29 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cog7Q3UM29 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cog7Q3UM29 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cog7Q3UM29 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cog7Q3UM29 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cog7Q3UM29 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cog7Q3UM29 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cog7Q3UM29 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cog7Q3UM29 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cog7Q3UM29 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cog7Q3UM29 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cog7Q3UM29 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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