Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll12Q3UDE2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms