Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cops9Q3U898 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms