Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf149Q3U2C5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnf149Q3U2C5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms