Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hhla1Q3TYV2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms