Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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