Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hdgfl1Q2VPR5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms