Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Shroom4Q1W617 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms