Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Traf3ip1Q149C2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Traf3ip1Q149C2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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