Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnn2Q08093 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnn2Q08093 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnn2Q08093 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cnn2Q08093 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cnn2Q08093 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cnn2Q08093 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cnn2Q08093 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnn2Q08093 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms