Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pou6f1Q07916 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms