Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sox12Q04890 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms