Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcad1Q04692 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms