Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scg2Q03517 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scg2Q03517 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms