Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms