Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfiaQ02780 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms