Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pax5Q02650 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms