Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RykQ01887 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RykQ01887 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RykQ01887 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms