Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cacna1cQ01815 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms