Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms