Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde1bQ01065 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde1bQ01065 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms