Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Serpina1cQ00896 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms