Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmmrQ00547 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmmrQ00547 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms