Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
rp9P97762 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
rp9P97762 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
rp9P97762 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
rp9P97762 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
rp9P97762 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
rp9P97762 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
rp9P97762 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
rp9P97762 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
rp9P97762 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
rp9P97762 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
rp9P97762 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
rp9P97762 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
rp9P97762 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
rp9P97762 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
rp9P97762 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
rp9P97762 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms