Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms