Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nbr1P97432 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms