Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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