Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Gbx1P82976 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx1P82976 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms