Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprvP70289 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PtprvP70289 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprvP70289 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms