Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TdgP56581 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdgP56581 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdgP56581 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdgP56581 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdgP56581 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TdgP56581 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdgP56581 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdgP56581 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms