Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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NcanP55066 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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NcanP55066 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NcanP55066 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NcanP55066 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NcanP55066 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NcanP55066 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NcanP55066 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NcanP55066 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NcanP55066 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcanP55066 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcanP55066 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NcanP55066 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NcanP55066 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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NcanP55066 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NcanP55066 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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NcanP55066 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NcanP55066 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NcanP55066 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NcanP55066 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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NcanP55066 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NcanP55066 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NcanP55066 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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